第二次世界大戰接近尾聲,在岡山縣日比海岸,赤城大夫(柄本明飾)繼承父親傳下的開業醫生必須鞠躬盡瘁的家訓,終日奔走,四處出診,卻只收取微薄的報酬。他發現許多居民都出現肝腫大的症狀,肝炎正在流行擴散。情勢不妙,赤城開始全力探索肝炎的病原體,並需要藉助顯微鏡研究肝炎病毒。 被僱來當看護助手的女孩園子(麻生久美子飾),是名從良的賣身女,她默默地愛著這位熱心的大夫。在園子、受重傷的荷蘭戰俘以及其他朋友的協助下,赤城努力救治染病的人們。不久,廣島上空升起了巨大的蘑菇雲,隔海而望,那雲的形狀就如同腫脹的肝臟……