警隊的“絕密檔案”，是指至今仍未偵破，科學查證又不能合理解釋的懸疑案件。陽任職警察部專案小組十多年，對這些謎題甚感興趣，奈何職權所限，遂決定與好友Judy請辭警隊併成立天眼研究所。成立第一天，一位神秘人物出現，提供經費並留下Helen的失蹤檔案。經調查後，二人發現Helen與失落文明瑪雅文化有關，考古學家推論這文明乃外星人所建立，更與末日預言扯上關係
